· Petites histoires naturelles : Chroniques du vivant, Arles, Actes Sud, 2021.
· L’origine du monde : Une histoire naturelle du sol à l’intention de ceux qui le piétinent, Arles, Actes Sud, 2021.
· Les goûts et les couleurs du monde : Une histoire naturelle des tannins, de l’écologie à la santé, Arles, Actes Sud, 2019.
· Jamais seul : ces microbes qui construisent les plantes, les animaux et les civilisations, Arles, Actes Sud, 2017.
· La Symbiose : structures et fonctions, rôle écologique et évolutif, Paris, Vuibert, 2000.